FAQ：宏基因组

关于细菌总基因组研究的7个事实

称为宏基因组的生物群落的总基因组。 例如，存在生活在人类口中的宏基因组细菌。 其实，它不是很准确，因为在牙斑中活着一个社区，语言在其他生命的顶部，从底部 - 第三个等。有人怀疑细菌群落是非常多样化的，但没有什么好的方法来描述这种多样性。

1.主要的惊喜之一，当通过鉴定遗传序列的分析方法，它只是多么巨大的品种。 它是数百基因组，大多数以前谁都不知道。 它们不是栽培的，即我们不能用经典的微生物剂研究它们，我们唯一能用它们做的是研究和比较它们的基因组序列。

在人类中，细菌细胞比其自身细胞大至少10倍。 从细菌的角度来看，我们只是走回家。 显然，细菌细胞基本上小于人类细胞，但是，我们携带1-2公斤细菌。

3.人 - 这个共生的生物，因为我们来自生活在我们里面的细菌，是非常依赖的。 例如，它们与我们的免疫系统相互作用。 许多自身免疫性疾病，特别是自身免疫性肠疾病是贫穷细菌菌群的结果：免疫系统开始干涸。 在某种程度上，我们的细菌保护免受病原体：如果你有一个健康的细菌群落，你已经进入肠道致病细菌，他们将无法渗透到这个社区。 此外，我们与这些细菌发生代谢。 维生素为我们产生肠道菌群：我们得到一些他们的食物，并使我们的肠道细菌的很大一部分。 氰钴胺注射液 -是DNA合成的关键。

有很多国际项目用于研究和比较人类微生物组成部分不同。 你可以描述它们的多样性，我们可以尝试描述一般的微生物组的功能特性。 不同的人有单独的微生物组。 已知肥胖的人和瘦肉结构的不同类型的细菌生活在肠内。 这可以通过实验来研究：你采取几个无菌的小狗，一些细菌感染另一个 - 另一个，即使从同一窝，幼崽，一些将比同等饲料的其他人百分之几十。

从医学的角度来看，抗生素的一个非常重要的影响，因为抗生素 - 是什么杀死细菌。 杀死你想要病原体，但你的草和他自己的细菌菌群。 有没有非常开胃，但是一个合理的程序，当一个人在给他大剂量的抗生素，收集粪便样本，然后恢复肠道微生物群落，这些样品被接种到他的肠子。

存在相当大量的细菌，所谓的机会主义，它们总是存在并且通常对于人没有影响，并且当改变微生物群落时具有高剂量抗生素的身体削弱或者具有问题免疫，他们开始引起疾病。

一个典型的例子是金黄色葡萄球菌，它存在于一半的人的皮肤上，而丹毒在这仍然不会发生。 这些细菌大多数没有栽培。

有世界海洋的美好作品宏基因组分析。 Craig Venter - 第一篇关于人类基因组的文章作者之一，其下一个大项目只是对海洋的宏基因组分析。 他买了一条船，从纽芬兰航行通过太平洋的巴拿马地峡，并在途中挖取水样，然后确定这些样本中细菌的基因组的序列。 在世界海洋中栖息的细菌，我们知道了很多，这与氧气的生产有很大关系，与森林相比，我们是如此积极地保护。 大量的氧使海洋中的单细胞蓝细菌。

有异常和非常漂亮的例子，不良的研究物种微生物组与不寻常的情况相关联。 例如，有一个前铁矿用酸性水，其实它是稀硫酸。 有几种类型的活细菌。 通常当你做宏基因组学，然后重建完整的基因组不能：你已经获得了片断。 当小物种，并阅读与很多的片断，然后他们开始粘在一起在完整的基因组。 已经存在经典的微生物和宏基因组方法的杂种。

还有一个关于海洋蠕虫Olavius algarvensis，没有胃的美妙故事。 相反，它有一些皮肤生活在共生细菌。 我们再次测序所有的一次，描述这些物种之间的代谢关系：一些氨基酸蠕虫有人帮助它提供呼吸的底物。 从蠕虫也需要细菌爬行它，因为他们自己不能长途跋涉。 结果是移动到所需浓度的硫，铁和二氧化碳的台车。 单独地，所有这些生物变得不可能：它们只能作为单个实体存在。 这是一个奇妙的宏基因组历史。